中心成立于1953年，属甘肃省林草局县级参公事业单位。原名为“甘肃省林业勘察设计研究院”，2002年更名为“甘肃省林业调查规划院”；2007年经省编办批复同意将甘肃省林业调查规划院加挂的甘肃省森林资源监测中心更名为“甘肃省生态环境监测监督管理局”，与甘肃省林业调查规划院实行1个机构、两块牌子管理；2008年3月甘肃省实施公务员法领导小组同意我局列入参照公务员法管理范围。2015年7月，省编办批复我局为公益一类事业单位（甘事改办复字［2015］69号），2021年5月更名为甘肃省生态资源监测中心（甘肃省林业调查规划院）。

现有编制173名、县级领导职数8名、其中：县处级正职2名，县处级副职6名。现有班子成员7人，县级以上干部15名。内设28个科（室）、中心。在职职工152名，其中博士2名，硕士57名，本科45名。有正高级工程师13名，高级工程师41名，工程师44名。

根据甘机编办通字[2007]112号文件，依法组织开展全省森林资源消长变化、荒漠化、生物多样性、环境影响因子、自然保护区及湿地消长变化监测；依法负责林业生态工程监理和核查，林地征占用勘验、流转评估及相关信息等工作。